A ver que creo que tienes un pequeño lío de conceptos... Lphant es un programa que soporta descargas usando el protocolo BitTorrent o usando el protocolo Emule/Edonkey.
El BitTorrent solo soporta el protocolo BitTorrent por lo tanto si tu estas bajando algo usando el protocolo Emule/Edonkey no lo podrás acabar de bajar por BitTorrent, podrías acabar de bajarlo usando por ejemplo el programa Emule. Para poder acabar de bajar lo que tienes en el lphant deberías de estar usando el protocolo BitTorrent y por lo tanto deberías de tener los
torrents que usaste para iniciar dichas descargas.