Si cambias la descarga de ubicación lo que tienes que hacer es borrar la descarga que tenías de la lista y vuelves a abrir el torrent que usaste para descargarlo. El uTorrent te preguntara donde lo quieres descargar, le tienes que decir donde ahora esta el archivo (en el disco duro externo) y el uTorrent automáticamente comprobará que el archivo esta completo y volverá a compartirlo.
En caso de que quieras subir un archivo que no bajastes con el uTorrent debes de
crear un torrent.